很快，平家战船上的水手一一被源氏武士射倒，平家的战船失去了控制。再加上这个时候水流方向发生了变化，不利于平家，平家军节节败退。主将平知盛一看大势已去，就来到了平清盛的夫人和安德天皇坐的御船上说：“看来大势已去，必将受害的人，还是让他们跳海自尽吧。”平清盛的夫人把三件神器之一的八坂琼勾玉夹在肋下，腰里插着草薙剑，抱起了八岁的安德天皇。她跟小天皇讲：“陛下不要害怕，波涛汹涌之下的大海，也有我们金碧辉煌的帝都。”然后投海自尽。这一幕像极了九十四年之后，在中国发生的陆秀夫背负南宋幼帝自尽。
安德天皇的母亲平德子也投海自尽，但是被源氏武士用挠钩抓住头发拖了上来，捡回了一条性命。另外一名平家贵妇抱着三件神器之一的八咫镜想跳海，被源氏士兵阻止，抢下了八咫镜。
平家武士当中，有头有脸的纷纷投海自尽。不甘心自杀的平家猛将平教经决定最后一搏，挥舞大刀向源氏的船上跳去，见到穿着华贵铠甲的就砍，直奔源义经杀去。源义经被迫从一艘船上跳到另一艘船上，一共连跳了八艘船，才躲开了平教经同归于尽的打法。平教经一看实在追不上源义经，就一只手抓起一个源氏武士，跳进滚滚波涛中，跟敌人同归于尽了。
这次战役平家的总指挥——平清盛的儿子平知盛，穿上两套铠甲，跳进了波涛当中，很快沉没在大海之中。平家宗主平宗盛畏惧投海，跟儿子平清宗一起做了源义经的俘虏，被押到京都游街示众。想当年他们在京都过着天上人间的日子，这个时候身为囚徒，故地重“游”，心中也是感慨万千！后来平宗盛父子被押到镰仓，源赖朝以胜利者的姿态接待了这位败军之将。在源赖朝面前，平宗盛气节尽丧，低声下气，乞求活命，可是源赖朝心狠手辣，绝对不会犯当年平清盛犯下的错误。如果当年平清盛不放自己，那么平家一门焉有今日？平宗盛被就地斩首，长子平清宗，幼子平能宗，也被处死，平家一脉就此断绝。
自平治之乱以来，统治日本二十多年的平家武士政权，在坛浦的战火中灰飞烟灭。
祇园精舍的钟声，有诸行无常的声响。娑罗双树的花色，显盛者必衰的道理。骄奢者难久长，正如春夜的一梦。强梁者终将败亡，恰似风前的尘土。
《平家物语》卷首的这首诗，千百年来为日本人所咏唱，诉说的其实不仅仅是平氏一门的昙花一现。
b谁也没见过的三件神器/b
前面讲过，每一次平氏出逃的时候，都是带着天皇和三件神器一起出逃。那么这三件神器是什么东西？为什么在日本这么神圣？
三件神器指的是八咫镜、草薙剑和八坂琼勾玉，简称剑、镜、玉，是保证皇位的宝物，天皇代代传承。有点儿像中国的大禹划天下为九州时铸的九鼎，成为夏商周三代代代相传的王权象征。当年楚国强大，楚庄王派人问鼎之轻重，表示有取而代之的野心，留下“问鼎中原”的成语。中国的九鼎传到秦末就失传了，而日本的剑、镜、玉一直传到今天。
根据日本古书《古事记》的记载，太阳神天照大神躲在天岩屋户里，宇宙没有了太阳。为了引诱她出来，一位大神用天金山的铁制作了八咫镜，对着天照大神照射，镜中照出了天照大神的神体，感到好奇的天照大神就露出了身姿。由于天照大神的身姿在镜中出现，镜子里就存有了她的魂，八咫镜就变成了天照大神的神体，在三种神器当中是最尊贵的宝物。
天照大神派自己的天孙琼琼杵尊降临到人间统治日本国的时候，把八咫镜交给了琼琼杵尊，神镜由此落入人间，一直到第十代崇神天皇为止。从此之后，八咫镜就成了代替天照大神神体的标志，真品被供奉在伊势神宫，复制品放在皇宫里。历代天皇继位的时候，用的镜子都是山寨版。
八咫镜到底什么样？按照古书的记载，直径两尺，内径一尺六寸三分，大概四十九厘米左右。但是这面镜子谁都没有见过，镜子的本体直到今天都不让目睹，就连神宫里的神官们都不能看，据说偷看者眼睛要瞎掉。八咫镜的镜盒每年更换一次，但都在半夜进行，替换者必须闭上眼睛，摸黑作业，弄得神神道道、鬼鬼祟祟的。
另一件神器草薙剑是天照大神的弟弟须佐之男命降临到人间的时候，碰上一位呼喊救命的美少女，说有一条大蛇，每年要吃一个美丽的姑娘，今年轮到她了。须佐之男命英雄救美，斩杀了大蛇。斩蛇的时候，从蛇尾掉出了一把剑，须佐之男命就把这把剑供献给了姐姐天照大神。
后来天孙降临人世，这把剑就被带到了人间，到第十二代景行天皇的时候，开始供奉在热田神社。与神镜相同，没有任何人见到这把剑的真容。据说在德川幕府时期，热田神社的大宫司和其他神职人员出于好奇，偷窥了草薙剑，不久这些人相继死去，只有一个人没死，将剑的体貌特征记录了下来。据他说草薙剑全长八十五厘米，刀柄上刻有鱼的背脊骨，刀身中央部分较厚，整个草薙剑形如菖蒲叶，呈白色，应该属于白铜剑。
至于八坂琼勾玉，传说是天照大神在天岩屋里的时候，八百万神命令玉祖制作的，形状好像动物的牙，又好像人的心脏，所以叫八坂琼勾玉。坂是尺度的意思，表示玉的大小。
根据日本第九十五代花园天皇的日记记载，勾玉跟日本皇室关系很深，一直存放在日本皇宫之中。放置勾玉的木箱上着锁，用青绢包裹，四角扎有紫色的丝带。如果包裹木箱的青绢旧了，不能将其更换，必须用一块新的丝绢重新裹盖在旧绢之上。木箱放置的时候，绝不允许倾斜。
据说日本第六十三代冷泉天皇，就是疯疯癫癫到处放火的那位，什么缺心眼儿的事儿都想干，出于好奇，曾经想打开木箱看看。当他解开丝带的时候，包裹勾玉的木箱突然冒出一股白烟，吓得疯子天皇惊慌失措，当即放弃了偷看勾玉的念头。
神武天皇继位之后，作为日本传国至宝的三种神器，先是存放在宫中，后来神镜被转到了伊势神宫保存，神剑存放在热田神宫，皇宫中仅有玉的真身。崇神天皇时代，复制了神镜和神剑，与真玉一起存放在皇宫。
平家逃离京都的时候，把三件神器全带走了。后鸟羽天皇继位，是在没有三种神器的情况下举行的仪式，这在日本天皇家也是第一次。
坛浦海战，平家全军覆没，平清盛的夫人抱着八岁的安德天皇和三件神器跳入大海，为的就是不让神器落入源氏手中，使得源氏支持的后鸟羽天皇没有合法性。但存放玉的箱子落入海中之后，由于浮力的作用，漂浮于海面，被源氏的军队捞起。神镜也被打捞出海，只有宝剑不见了踪影。宝剑本身的重量已是不轻，再加上剑鞘的重量，一入海可能直接沉到海底了。虽然源家花费了大量的人力物力，进行了长时间的搜寻，无奈大海捞针，谈何容易。
天皇家一直到1189年，也就是坛浦之战后四年才放弃了寻找宝剑。从此神剑真身就不见了踪影。三件神器缺了一个，天皇家遭遇了非常严重的问题，后代天皇怎么继位呢？无奈之下，朝廷只好决定，退而求其次，用天皇宝座边上放置的御座之剑为草薙剑的替代品，这也是个没有办法的办法。
以前朝廷举行仪式的时候，都是剑在先、玉在后。宝剑丢失之后，就变成了玉在先、剑在后。
b打了胜仗却不受待见/b
坛浦海战之后，源义经派人到镰仓，给哥哥源赖朝送了一份战果报告。内容主要有这么几点：首先报告安德天皇跳海自尽了，其次详列了平家被俘和跳海者的名单，最后说草薙剑丢了。
这份报告令源赖朝非常不满。源赖朝对平家动武的最大目标，是要夺回安德天皇拥有的剑、镜、玉三件神器。为此，赖朝下了死令，如果在平家灭亡和三件神器之间二选一的话，宁可不要平家灭亡，也要三件神器。没有三件神器，就没法控制天皇，没法建立他的关东武士国。
可惜，源义经没有理解哥哥的这一份苦心，把宝剑弄丢了。面对坛浦海战如此辉煌的胜利，源赖朝只评价了一句话，这傻家伙根本就不知道最重要的东西是什么。
源赖朝对弟弟的不满不是从遗失了草薙剑开始的。一之谷大战后，源义经得胜回到京都，后白河法皇非常高兴，封义经为左卫门少尉，加检非违使。检非违使又被称为判官，源义经从此被日本人称作源九郎判官义经。对于源义经不经请示、擅自接受法皇厚封之事，赖朝勃然大怒。
源赖朝虽然非常生气，只是当时源平两家鹿死谁手尚无定论，还需仰仗能征善战的义经带兵打仗。于是赖朝强压怒火，暗暗忍了下来。如今平家已灭，岂能再容源义经？坛浦海战后一个月，赖朝下令，东国武士不许听从义经指挥，实际上把源义经的官给罢了。紧接着，赖朝收回了赏赐给义经的原本属于平家的二十四块领地。
义经刹那间变得无权无财，却不明白是怎么回事儿，根本不了解哥哥的心思，于是亲自押解抓获的平宗盛等平家俘虏赶往镰仓，幻想见到哥哥，一切美好如旧。
结果，赖朝连镰仓幕府的大门都不让义经进，把他撵到相模国的腰越驿安置。义经觉得很委屈，写了一封言辞恳切的信，向赖朝表功的同时，诉说自己的委屈，这就是日本历史上有名的“腰越状”。
但是赖朝这个时候已经对功高盖主的弟弟动了杀心，在赖朝的眼中，威胁到自己地位的人必须死。
b名将如花般凋零/b
义经不能进入镰仓大门，只好返回京都。
在返京途中，义经得知平宗盛父子被斩首。这个时候，义经看出来哥哥有敲山震虎、威胁自己的意思。回到京都之后，义经就准备公开跟哥哥决裂了。
赖朝为了置义经于死地，召集手下武士问计：我弟弟现在名头这么响亮，粉丝比我还多，怎么办？你们谁敢去杀义经？
源氏武将都沉默不语。虽然镰仓公待我等恩重如山，但是毕竟九郎是灭平氏的首功之人，要去杀他，大家觉得于心不忍。只有与义经早生嫌隙的梶原景时，给源赖朝出主意，让他派一个叫土佐坊昌俊的和尚到京都去谋杀义经。
土佐坊昌俊来到京都，意图刺杀之时，被义经识破，写下悔过书，宣誓不再刺杀义经。但等到他返回京都居所，竟然出尔反尔，率领六十多名骑兵，偷袭义经居所。结果被义经的手下七骑以一当十，打得大败。土佐坊昌俊也被义经活捉。
义经非常生气，指责土佐坊昌俊违背誓言，应该受到惩罚。土佐坊昌俊肉烂嘴不烂：“是镰仓公让我杀你的，我不算违背誓言。”义经一生气，给他一大嘴巴。土佐坊昌俊又说：“你打的不是我的脸，是赖朝将军的脸。”义经一听这话，心里也是一激灵。两国相争，各为其主，土佐坊昌俊倒也算条汉子。义经问他：“你想不想回镰仓？”土佐坊昌俊说：“我既然不幸被擒，你就赶紧把我杀了吧。”义经只好亲手杀掉了土佐坊昌俊。
随后，义经就向后白河法皇讨得了征讨哥哥源赖朝的院宣。赖朝听说之后，率领源家诸将，出兵讨伐义经。法皇这个时候是两边都不敢得罪，给了义经讨伐源赖朝的院宣之后，怕赖朝生气，又下达了让西国武士追讨义经的院宣。
义经率两百多骑郎党出行，不幸在扬帆去九州的途中遇上暴风，船只沉没，两百多一骑当千的勇士全部葬身大海，义经这下彻底没咒念了。
义经走投无路，只好带领数名郎党亡命到了奥州，投奔藤原氏。此时的藤原氏已经传到第四代藤原泰衡的手里。泰衡收留了义经之后，经不住赖朝不断施加压力，加上内心害怕源义经有朝一日“鸠占鹊巢”，遂于文治五年（1189年），亲率五百人包围了义经主从居住的衣川馆。
义经手下只有十余人，虽拼死抵抗，终究寡不敌众。义经麾下第一大将武藏坊弁庆手持大刀，跟奥州兵缠斗许久，最后被乱箭射成了刺猬，死尸立而不倒。义经眼见郎党纷纷阵亡，心知大势已去，于是杀死正妻和年方四岁的女儿，在火中自尽身亡，享年只有三十岁。
日本人把擅长偷袭、以少胜多的军事天才义经形容成“战场之花”，也许就是因为源义经壮丽而短暂的一生就像花儿一样，一经绽放便迅速凋谢。
源义经死后，头颅被浸泡在酒中，装入黑漆匣子送往镰仓。梶原景时检查了首级，确认无误之后，上报源赖朝。
源义经悲惨的遭遇，非常符合日本人崇拜悲剧英雄的情怀。在日本人的心目中，源义经变成了一个神话，很快民间就出现了不少义经没死的传说故事。最离谱的是，到了明治时期，日本的一位政治家通过自己的所谓“考察”，把传说进一步发展成了源义经就是成吉思汗的论点，认为源义经没有自尽，而是逃出生天，渡过大海，经北海道前往大陆，最后变成了成吉思汗。他的这个所谓的“学术成果”，特别符合当时日本向中国大陆扩张的需要，轰动一时。但是在今天看来，简直就是一个笑话。